1) Как заставить юнита юзать нестандартный скилл, думаю это самая важная деталь из всего вашего вопроса.
Отвечаю:
Надо через триггеры использовать команду: Юнит - отдать приказ (с целью/без цели/цель земля) суть в том, что надо использовать скилл, на основе которого сделана магия. Если юнит обладает магией сделанной на основе "молота бурь" (или как там стан у гнома), то если ему приказать кастовать стандартный моло бурь, то он скастует лишь тот, что есть т.е. тот нестандартный и измененный вами молот бурь, что вы дали ему.